一、民國47年6月6日奉教育部台（47）高字第8117號令：校名為「中國醫藥學院」。
二、民國47年7月1日本校第一屆董事會成立。
三、民國47年10月10日辦理招生，初期招考醫科新生兩班，於12月1日正式開學。
四、民國61年8月1日，將醫科之名稱改為醫學系。
五、民國92年8月1日，教育部函（發文字號：台高（三）字第0920058889D號）獲教育部審核通過改名為「中國醫藥大學」
六、民國92年8月1日配合學校改制大學成立醫學院
目前醫學系設系主任一名及副系主任兩名（基礎學科、臨床學科），設立解剖、生理、生化、微生物及免疫、藥理、寄生蟲、病理、社會醫學科等八個基礎醫學科；內科、外科、婦產科、小兒科、耳鼻喉科、眼科、皮膚科、放射科、神經科、精神科、家庭醫學科、復健科、麻醉科、骨科、泌尿科、腫瘤治療科、急診醫學科、核子醫學科、實驗診斷學科等十九個臨床學科。由系主任綜理系務，各學科設科主任一名，負責課程安排、教學研究及科務。